Вертикальные резервуары РВС-1000 объемом 1000 м3 предназначены для предварительной подготовки сточных вод. Они спроектированы и изготовлены российским ЗАО «Самарский завод котельно-вспомогательного оборудования и трубопроводов». Всего будет смонтировано 6 таких резервуаров. Высота каждого 12 метров, диаметр — 10 метров.
Строительство «Биосферы» началось в октябре 2015 года в присутствии мэра Москвы Сергея Собянина и министра природных ресурсов и экологии РФ Сергея Донского. Проект предполагает использование уникальной для российской нефтепереработки технологии очистки сточных вод. Установка будет состоять из блока двухступенчатой флотации, мембранного биореактора, системы обратного осмоса и угольных фильтров, блоков обезвоживания активного ила и нефтешлама. Базовый проект установки разработала российская компания «НПК Медиана-Фильтр». Инвестиции в строительство «Биосферы» составят более 7 млрд рублей.
В рамках первого этапа модернизации на предприятии уже построены новые закрытые механические очистные сооружения закрытого типа. Они обеспечивают эффективность очистки сточных вод МНПЗ до 95%. Также в 2015 году на заводе началось строительство новой установки очистки сернисто-щелочных стоков и технологического конденсата.